ספרות עברית וערבית של ימי הביניים; שירים עבריים במרחב שיח של שירים ערביים ושל סיפורים ערביים; דרכי הבנה ופרשנות של טקסטים קדומים; קריאה חדשה בשירה ישנה.

ספרים:

- חביבה ישי, וּבְגַן עֵטִים וּכְתָבִים נִתְעַלְּסָה בָּאֳהָבִים; ספרות האהבה בחלל השיח התרבותי העברי-ערבי בימי הביניים, ירושלים, יד יצחק בן צבי והאוניברסיטה העברית בירושלים, 2011.

עריכת ספרים:

- חביבה ישי, משה אבן עזרא: שירים (עם הקדמות והערות), תל אביב, אוניברסיטת תל אביב, ההוצאה לאור ע"ש חיים רובין, 2010.

- חביבה ישי [עם עלי יסיף ואוריה כפיר], אות לטובה: פרקי מחקר מוגשים לפרופסור טובה רוזן, מכון הקשרים לחקר הספרות והתרבות היהודית והישראלית ומרכז מ"ד גאון לתרבות הלאדינו, אוניברסיטת בן גוריון בנגב, 2012.

מאמרים:

- חביבה ישי,"טכניקת ה'מיקוד' בשירי חשק של שלמה אבן גבירול; המסמן המקראי בשיר כעדשה ממקדת במצלמה", ראה 5 (2001), פריס, אוניברסיטת פריס, עמ' 51-39.

- חביבה ישי,"טקסט כאינטרטקסט – שירי אהבה עבריים וסיפורת האהבה הערבית בימי הביניים", טובה רוזן ואבנר הולצמן (עורכים), מחקרים בספרות העברית בימי הביניים ובתקופת הרנסנס מוגשים לפרופ' יונה דוד, תעודה י"ט (2002), תל אביב, אוניברסיטת תל אביב, עמ' 72-55.

- חביבה ישי,"היש לריב עם מריב? – הסתכלות חדשה על דמות
המריב ועל אורחותיה בשירת האהבה העברית מספרד, מכאן ג' (2002), באר שבע, אוניברסיטת בן גוריון בנגב, עמ' 119-101.

- חביבה ישי,"היום כבר לא מתים מאהבה" – על אפשרות החזרתה לחיים של קונוונציה מתה בשירי אהבה עבריים חילוניים מספרד", בקורת ופרשנות 39 (2006), רמת גן, אוניברסיטת בר-אילן, עמ' 43-17.

- חביבה ישי,"'פִּצְעֵי בְּנוֹת עֹפֶר': על פרקטיקה של מחלה וייצוגיה בשירה העברית", איל פריזינטי: מחקרים בתרבות יהודי ספרד ה' (2011), באר שבע, אוניברסיטת בן גוריון בנגב, עמ' 119-103.

-חביבה ישי,"סיור ב'גן השבילים המתפצלים' של 'ספר שעשועים'", אפריים חזן ושמואל רפאל (עורכים), מחברות ליהודית: קובץ מחקרים מוגש לפרופ' יהודית דישון (2012), רמת גן, אוניברסיטת בר-אילן, עמ' 57-43.

- חביבה ישי,"על מרידתו האדיפלית של טדרוס אבולעאפיה, רוויזיוניסט אינטלקטואלי במאה השלוש-עשרה בספרד", עלי יסיף, חביבה ישי ואוריה כפיר (עורכים), אות לטובה: פרקי מחקר מוגשים לפרופסור טובה רוזן (2012), מכון הקשרים לחקר הספרות והתרבות היהודית והישראלית ומרכז מ"ד גאון לתרבות הלאדינו, אוניברסיטת בן גוריון בנגב, עמ'195-176.

- חביבה ישי,"שירי בית הסוהר של טדרוס אבולעאפיה: ביוגרפיה של סוגה", פעמים 134-133 (2013), ירושלים, מכון בן צבי לחקר קהילות ישראל במזרח, עמ' 76-53.

- “Hebrew Poetry in light of Arabic Prose; Intertextuality as a way to gather Poertry's and Prose’s Forms in Medieval Love Literature", C. Szyska, F. Pannewick (eds.) Crossing and Passages in Genre and Culture (2003), Germany, Wiesbaden, pp.155-161
- "The Political Philosophy in the Proverbs of Shmuel Hanagid, Servant of Two Kings",
Marie-Christine Bornes-Varol, Marie-Sol Ortola (eds.) Aliento – Corpus, Genres, Theories et Methodes 1 (2010), France, Nancy University, PP. 131-147.

- משוררים עבריים בעולם מוסלמי
- "ואין איש חי לא יחשוק..." – על תורת האהבה וחוכמתה בספרות העברית בימי הביניים.
- "חמשה ימלאו הלבות בשמחות..." – על שעשועי החצר בתרבות העברית והערבית בימי הביניים
- בין אהבה אנדלוסית לאהבה קסטיליאנית – שיח האהבה העברי בספרד בימי הביניים
- טקסט ונמעניו – איך קוראים טקסט מימי הביניים?
- טקסט ונמעניו – מי קורא טקסט מימי הביניים?
- מקריאה אינטרטקסטואלית לחוויה אינטלקטואלית בשירה העברית מימי הביניים