Recording of Presentation on project course
Proposals (2022-23)
======================================================================================
Projects in computational vision and robotics / Prof. Ohad Ben-Shahar
======================================================================================
Building an interface for Molecular Characterization in a Drug Development Process / Prof. Barak Akabayov, Dept. of Chemistry.
The interface will allow a user to choose a dataset and perform molecular characterization that will enable classification of molecules by structural similarity (like the classification of pictures or other objects).
======================================================================================
פרויקטים בביואינפורמטיקה / פרופ' חן קיסר
מחקר הגדול - חרקים ממלאים תפקיד מרכזי בסביבה. הבנת הדינמיקה של האוכלוסיות שלהם בזמן ובמרחב חיונית לשמירת טבע, לחקלאות ולרפואה. מלכודות דבק הן אמצעי פשוט וזול לניטור אוכלוסיות חרקים אבל הניתוח שלהן דורש כיום עבודה ידנית מרובה של מומחים. מטרתנו במחקר היא לפתח כלי בינה מלאכותית, בסיס נתונים וממשק רשתי כדי לאגור, להפיץ ולנתח תמונות המתקבלות מסריקה של מלכודות דבק.
- השלב הראשון של פרויקט המחקר התפרסם:
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fevo.2021.600931/full
- אתר הבית של הפרויקט, שנמצא בשלבי פיתוח ראשוניים ופונקציונאליות חלקית מאוד:
https://stardbi.cs.bgu.ac.il/home/welcome
הפרויקטים להלן הם חלק מהשלב הבא במחקר:
1. בחינת אלגוריתמי קלסיפיקציה כלליים חדשים לזיהוי חרקים.
2. עידון מודלים כלליים כך שייתנו תוצאות טובות יותר על שאלות מחקר ספציפיות – זיהוי מדויק יותר של מינים מסוימים בעלי חשיבות כלכלית או רפואית.
3. סגמנטציה של תמונות חרקים כדי לזהות חלקי גוף שונים ולבצע מדידות של מאפיינים גופניים (למשל אורך הגוף).
4. שיפור הפונקציונאליות של האתר - מתאים לתלמידים/ות בעלי רקע בתכנות רשת ו\או מסדי נתונים
=======================================================================
Developing an extended web interface to a genetic retrieval system / Prof.Ehud Gudes
- The main functionality of GeniePool is to provide information about known DNA samples by the given genomic coordinates. Then, a researcher can analyze those samples and the associated data. One desirable feature (performed manually today) is to find contact information of the researchers related to the particular DNA samples (mainly emails). To do that, there is a need to build a non-trivial service that performs crawling of the relevant web pages to find the required data. This functionality should be exposed as a web-service API that will be used by the GeniePool.
Contact: gudes@bgu.ac.il
Selected Projects
