מכון אילזה כץ הוקם בשנת 2006 ומאחד תחת קורת גג אחת, קהילה של מדענים העובדים יחדיו על היבטים שונים הקשורים להבנת החומר בממדיו הננומטרים. מחקר מתקדם בננוטכנולוגיה מובא במכון בתחומים שונים כגון: התמרה ואחסון אנרגיה, ביו-פיסיקה, מדע קוונטי, שכבות דקות, סינטזת חומרים ננומטרים ואיפיונם.
על מנת לאפשר את כל אלו, מעבדות המחקר במכון משרתות לחוקרים כמרכז תמיכה לחדשנות ומצוינות במחקר באמצעות הענקת הטכנולוגיות והתשתיות המתקדמות והחדשניות ביותר לייצור ואפיון חומרים ננומטרים לטובת כלל קהילת המחקר בנגב. הציוד מתופעל על ידי מפעילים מקצועיים ומצטיינים כל אחד בתחומו.
