תכנית הלימודים כוללת הרצאות פרונטליות, פיתוח מיומנות תוך ביצוע ניסויים במעבדה והשתלמות אינטנסיבית (סטאז') במעבדות רפואיות ומעבדות מחקר מוכרות ומאושרות ברחבי הארץ.
הלימודים בתוכנית זאת נועדו להכשיר תלמידים ברמה הגבוהה ביותר בתחומי מדעי הרפואה ומדעי הרפואה המעבדתית ולהקים את דור העתיד בתחומי המעבדה הרפואית. במסגרת זו ילמדו קורסים בסיסיים במדעי הטבע ומדעי החיים כגון מתמטיקה, פיסיקה, מדעי המחשב, כימיה כללית ואורגנית, ביוכימיה, ביוסטטיסטיקה ואפידמיולוגיה, וקורסים מתחומי מדעי הרפואה הכוללים הרחבה בתחומי המעבדה הרפואית כגון: מבנה גוף האדם, אימונולוגיה, בקטריולוגיה ומיקולוגיה, פרזיטולוגיה, וירולוגיה, המטולוגיה, היסטולוגיה, פתולוגיה, אנדוקרינולוגיה, הפריה חוץ גופית ורביה, פרמקולוגיה ופרמקוקינטיקה, ציטוגנטיקה, ביולוגיה מולקולרית, הנדסה גנטית, גנטיקה כללית ומולקולרית. כמו כן נלמדים קורסים ספציפיים לניהול מעבדות רפואיות כגון: מיכשור וטכנולוגיות ברפואה, היבטים בניהול המעבדה הרפואית. קורסי הבחירה כוללים קורסים הניתנים לתואר שני ושלישי וקורסים ייחודיים בנושאים הנמצאים בחזית הרפואה והמדע.
קורסי הכנה בכימיה, פיסיקה ומתמטיקה, במסגרת המכינה הקדם אקדמית, מתקיימים לפני פתיחת שנת הלימודים.
התוכנית המוצעת משתרעת על פני שלוש שנות לימוד (6 סמסטרים) בהיקף כולל של 145 נקודות (קורסי חובה וקורסי בחירה) ועוד 500 שעות סטאז' הכוללים התנסות מעשית (חלק מהסטודנטים ידרשו לבצע את ההתנסויות במעבדות במקומות אחרים בארץ)ופרויקט מחקר מדעי-רפואי, שבסיומן יוענק התואר "בוגר" (B.Med.L.Sc.) במדעי המעבדה הרפואית. התואר הניתן, יאפשר לבוגרים המשך לימודים לתארים גבוהים יותר(Ph.D., M.Sc.) בתחום מדעי החיים, הרפואה והביוטכנולוגיה כפוף לדרישות המקובלות באוניברסיטאות בארץ ובעולם.
זה התואר היחיד שבסיומו יוענק למסיימים רישיון עבודה מטעם משרד הבריאות, והם יוכלו להשתלב במעבדות מחקר ובמעבדות רפואיות במערך הרפואי הכללי והאוניברסיטאי, בתעשיות כלליות ורפואיות מתקדמות, ולאחר הכשרה מתאימה גם בהוראה.
הלימודים מתקיימים בקמפוס החדש של אוניברסיטת בן-גוריון בנגב ובפקולטה למדעי הבריאות במרכז הרפואי האוניברסיטאי "סורוקה". לרשות הסטודנטים עומדים כל מתקני הקמפוס ושירותיו וכן שירותי האוניברסיטה האחרים, לרבות הספרייה, כיתות המחשבים והמעבדות. לרשות הסטודנטים מעונות בהם מתקיימות גם פעילויות חברתיות, סרטים ומופעים, מרכז הספורט הכולל בריכת שחיה, מגרשי טניס וכדורסל, חדרי כושר ופעילות ספורט ייצוגי וכן מסעדות וקפיטריות, חנויות, בתי-כנסת, שירותי בנק דואר, ועוד.
לשכת דיקן הסטודנטים מעמידה אמצעי סיוע לסטודנטים (מלגות, מלגות התנדבות, הלוואות ועוד), סיוע למשרתים במילואים ולסטודנטים עולים ושירותי יעוץ וטיפול בעניינים אקדמיים. אגודת הסטודנטים גם דואגת למתן שירותים אקדמיים, חברתיים, כלכליים ותרבותיים לסטודנטים.
המסלול הישיר לתואר שני במדעי הרפואה –
נפתח מסלול חדש המאפשר לסטודנטים המצטיינים בשנתיים הראשונות לתואר, להתחיל את לימודיהם לתואר שני במדעי הרפואה, כבר משנה ג' של התואר הראשון ולקבל מלגת קיום במסגרת זאת יורחב פרויקט המחקר ותוצאותיו עשויות להיכלל בתזה של התואר השני. הסטודנטים במסלול זה ילמדו קורסים לתואר השני, בנוסף לקורסים בשנה ג' של התואר הראשון. המשך לימודיהם לתואר השני יותנה בסיום חובותיהם ובזכאותם לתואר הראשון.
