שמות ונושאים

לאחרונה, השלמנו פיתוח של שיטה חישובית לתכנון סיבים אופטיים מתקדמים. בפרויקט נממש ונבדוק את השיטה.

ביצוע חישובים נומריים ב- MATLAB )ואולי גם ב- COMSOL Multiphysics).

שליטה בחומר מקורס מבוא לפוטואלקטרוניקה (או קורס מקביל לו) וניסיון ב –  MATLAB מהווים יתרון.

מטרת המחקר לבחון את התכונות של בטון הכולל פלסטיק ממוחזר שעבר תהליכי טיפול שטח פנים להגדלת ההידבקות עם הבטון. המחקר כולל ניסויים מבוקרים וכלים חישוביים.

הסטודנט/ית ילמדו לתפעל את מכשיר ההעמסה.  ילמדו על סוגי המדידים השונים (כוח, תזוזה, עיבורים וצילום לצורך עיבוד תמונה) ויפענחו את תוצאות הניסויים. ניתן יהיה לשלב גם אנליזה נומרית של הניסוי בהתאם למידת הסקרנות של הסטודנט/ית.

* רקע באלמנטים סופיים. שליטה בתוכנה מסחרית כגון ANSYS או ABAQUS - יתרון .
* אנגלית טכנית ברמה טובה.
*מוטיבציה גבוהה.

Giant unilamellar vesicles (GUVs) are micron-sized spherical compartments enclosed by a phospholipid bilayer.  With dimensions and membrane composition similar to cells, GUVs are the most employed artificial cell model for studying various cellular phenomena, directly under the microscope. The aim of this project is to develop a novel technique for synthesizing GUVs by inducing a fusion reaction between small unilamellar vesicles (~100nm in diameter) at the interface of oil droplets. The proposed method offers a new concept by which GUVs, with well-defined membrane lamellarity and composition, are formed in solution and will enable the development of more realistic artificial cell models. In the proposed project you will learn various methos for preparing nanometric liposomes and emulsions as well as how to monitor the process of GUVs formation in real-time using fluorescence microscopy.     

קריאת מאמרים מדעיים, הכנת תמיסות ואמולסיות, שימוש במיקרוסקופ פלואורסנטי.

ידע בסיסי בכימיה וביולוגיה.

 במחקר המוצע הסטודנטים יוכלו לבחור בהתנסות בפן תיאורטי/ניסוי/חישובי של בעיות הנדסיות בתחום אינטראקציית זורם-מבנה כגון: פרפור של כנפיים, אי-יציבויות אווירואלסטיות של גופים אלסטיים כתוצאה מאינטראקציה עם שדרת ערבולים ועוד.

בהתאם לבחירה של הסטודנטים הם ידרשו: לעסוק במידול וניתוח אנליטי/לבצע ניסוי במנהרת רוח/לבצע סימולציות במחשב.

הסטודנטים נדרשים להגיע עם רקע מעמיק במכניקה, יכולות  מתמטיות גבוהות, מוטיבציה ויוזמה.

בעזרת מערכת PIV ניתן למדוד את שדה המהירויות של זורם.
מטרת העבודה: סיקור ובחירה של תוכנה חינמית לעיבוד נתוני PIV ומיפוי שדה הזרימה.

1. לימוד והכרת אופן הפעולה של מערכת PIV.
2. עריכת ניסויים ומיפוי  שדה מהירויות במערכת ניסוי  במעבדה.
3. סקירה של תוכנות חינמיות Open PIV PIV Lab.
4. יתרונות חסרונות. בחירת תוכנה חינמית וביצוע ניסוי בעזרתה.

עבודה בסביבה ממוחשבת, matlab, פיטון.

לאחרונה התגלה כי הקפיצה של טיפה על משטח נוזלי אינו אירוע דטרמיניסטי אלא אירוע הסתברותי/סטטיסטי. במחקר זה אנו בוחנים את תלות הסתברות הקפיצה של טיפות במספר פרמטרים כגון מתח פנים, גיאומטריה, עומק הנוזל, ומהירות נפילת הטיפות. בנוסף ננסה להבין מדוע מדובר בהסתברות ולא במשהו דטרמיניסטי תוך השוואה עם תחומים פיסיקליים אחרים.

שימוש במערכת ניסוי ופענוח תוצאות בתכנת frame-by-frame, ביצוע חישוב קצר ( חישוב כיול, שורה אחת) לקראת כל ניסוי, סיכום מסודר של התוצאות והפענוח.

ידע בסיסי בתרמודינמיקה ומכניקת זורמים.

ההתכווצות הספונטנית של טיפות שמתפשטות הינה בעיה מרכזית בתחום מדע בין-משטחי עם יישומים בעולמות הרפואה ובהדפסות תלת-ממד בין השאר. במחקר זה אנו נבחן את השפעת הריכוז של חומר פעיל שטח על אנרגיות פני השטח וכן על ההתכווצות הספונטנית ונאפיין את ההתכווצות מבחינה גיאומטרית, מכאנית וכימית.

שימוש במערכת ניסוי כולל הכנת תמיסות והכנת משטח לקראת כל ניסוי (קילוף משטח מתוך bulk), פענוח תוצאות בתכנת frame-by-frame, סיכום מסודר של התוצאות והפענוח.

ידע בסיסי בתרמודינמיקה ומכניקת זורמים.

משחר ההיסטוריה אנשים השתמשו בביגוד מחמם. ביגוד מקרר לא היה ועדיין אין. אנחנו נשנה סידרי עולם ונשווק קירור לביש. בהתחלה נכבוש את השוק התירפיאוטי, בהמשך העולם כולו.

יצירת מודל כלכלי.

נטייה ליזמות. מועמדים מכל רקע ישקלו.

אינטראקציות חלבון-חלבון (PPIs)  מפקחות על מספר רב של תהליכים תאיים כגון גדילה, שרידות של התא, הידבקות תאים, העברת אותות, ויסות חיסוני ועוד.  דה רגולציות של PPIs  ידועות כגורמות למחלות פיזיו-פתולוגיות שונות כמו התפתחות סרטן, מחלות זיהומיות, הפרעות נוירולוגיות ודלקות. עיכוב PPIs ע"י מולקולות הנקראות "מדלטורים" מזוהה יותר ויותר כאסטרטגיית התערבות טיפולית במחקר גילוי התרופות. מתוך מאות אלפי מחלות שקשורות בחוסר וויסות PPI רק אחוזים מעטים יועדו לפיתוח תרופתי. בשימוש בשיטות סריקה מסורתיות למציאת מדלטורים ל PPIs, אחוז ההצלחה קטן מאוד. לכן, גישות מבוססות למידת מכונה נחשבות כיום ככלים בעלי חשיבות גבוהה לחיזוי מדלטורים ל- PPI. השימוש באלגוריתמי למידת מכונה בניתוח אוטומטי של נתונים ביולוגיים בקנה מידה גדול כבר חולל מהפכה במחקר הביו-רפואי ובגילוי תרופות, בעיקר בשל חסכון משמעותי של זמן, כסף ומשאבים. אנו מציעים גישה שתשלב מינוף אלגוריתמים של למידת מכונה ומומחיות פרמקולוגית, להפחתת מספר התרכובות הדורשות סינון ניסיוני, ובכך לזרז את הגילוי והפיתוח של תרופות טיפוליות חדשות, מה שיוביל לטיפולים יעילים יותר למחלות הקשורות לחוסר ויסות PPI.

1.  קריאה, הבנה ולפעמים גם מימוש שיטות שונות שמוצגות במאמרים בדומיין של למידת מכונה ביואינפורמטיקה.
2. מימוש מתודולוגיות data science הכוללות:
- Data acquisition
- Data cleaning & cleansing
- Feature extraction
- Feature selection
- Machine/deep learning models' development
- Evaluation

 שליטה בתכנות בפייתון, הכרות עם ספריות שונות לניתוח נתונים, הכרות עם למידת מכונה, למידה עמוקה וספריות רלוונטיות כמו sklearn ו- pytorch, מוטיבציה גבוהה ללמידת מתודולוגיות וגישות בלמידה חישובית.

התוצר של הפרויקט הוא מודל שפה בינה מלאכותית לעברית שישלב תורה פסיכולוגית עם ביג דאטא. הפרויקט בשיתוף עמותת סה״ר לסיוע והקשבה ברשת. הפרויקט משלב למידת מכונה ובינה מלאכותית.

ניתוח של מידע קיים מרשת סה״ר, הפעלה וביצוע של אלגוריתמים, יכולת בקריאה מדעית באנגלית.

קורס מבוא בבינה מלאכותית או עבוד שפה טבעית, יכולת תכנות ברמה גבוהה.

1) יצירה אוטומטית של טקסט עלילתי לפי "מתכון" ובדיקת איכותם.
2) יצירת "מבקר ספרות" אוטומטי ובדיקתו על טקסטים עלילתיים.
3) בדיקת חוקיות "סיבה – תוצאה" בטקסטים עלילתיים.
4) בדיקה מבנית של טקסטים עלילתיים ארוכים.
5) התאמת טקסט עלילתי לגיל הקורא.

1) סקר ספרות.
2) התקנת או כתיבת תוכנה.
3) ביצוע ניסויים ליצירת נתונים.
4) ניתוח סטטיסטי של ממצאים.
5) כתיבת דוח מחקר בצורת מאמר ומצגת.

שנה ב ומעלה עם יכולות תכנות וידע בסטטיסטיקה.