המחלקה להנדסת מערכות תוכנה ומידע מעניקה תואר בהנדסת מערכות מידע וכן תואר בהנדסת תוכנה בשיתוף המחלקה למדעי המחשב.
מטרת תכנית הלימודים לתואר בהנדסת מערכות מידע היא להכשיר סטודנטים בעלי השכלה איכותית היכולים להשתתף באופן מועיל בתכנון, פיתוח, הקמה וישום של מערכות ממוחשבות.
תכנית הלימודים מספקת לתלמידים עקרונות וטכניקות המהווים בסיס ידע עיקרי לאנשי מקצוע במגוון תפקידים במערכות מידע ממוחשבות בסביבה הטכנולוגית המודרנית. הלימודים בתחום המקצועי של הנדסת מערכות המידע כוללים נושאים יסודיים בתחום כגון: ניתוח ועיצוב מערכות ובסיסי נתונים וכן קורסים הקשורים לטכנולוגיות מידע מתקדמות כגון: אחזור מידע, כריית נתונים, אבטחת מידע, מערכות מידע רפואיות, בסיסי נתונים מבוזרים, למידת מכונה ועוד.